Hodnocení příznaků (průjmy, příměs krve a hlenu v textu průjmu, bolesti břicha, únava, zvýšené teploty, bolestivá nucení na stolici – tzv. tenesmy apod.)
Pohmat břicha, pátrá se po bolestivosti nad postiženým úsekem střeva či rezistencích (hmatných patologických útvarech)
Pátrání po přítomnosti mimostřevních projevů (kožních změnách apod.)
Krevní obraz.
Zánětlivé parametry (CRP, sedimentace, zvýšení bílých krvinek).
Proteiny, hladina albuminu.
ANCA a ASCA protilátky (pozitivita ANCA a nepřítomnost ASCA protilátek svědčí spíše pro ulcerózní kolitidu).
Kultivace, virologické, případně parazitologické vyšetření při nutnosti vyloučení infekčního původu obtíží.
Test na okultní (skryté) krvácení ve stolici – tj. krvácení okem neviditelné.
Kolonoskopie (koloskopie) – jedná se o metodu vyšetření tlustého střeva, kdy je koloskop (jednoduše řečeno hadička s kamerou) zaveden konečníkem do střeva.
Gastroskopie – vyšetření žaludku, spojené též s vyšetřením jícnu a dvanáctníku, gastroskop (hadička s kamerou) se ústy zavede do žaludku, který se důkladně prohlédne, případně se odeberou vzorky k histologickému vyšetření.
Kapslová enteroskopie (kapsuloskopie) – jedná se o obrazové vyšetření tenkého střeva speciální diagnostickou kapslí, která má velikost větší vitaminové kapsle a je vybavena mikrokamerou.
Enteroklýza – jedná se o způsob rentgenologického vyšetření tenkého střeva se zavedením sondy do dvanáctníku, resp. až do lačníku (obě jsou části tenkého střeva) s následnou aplikací kontrastní látky.
Irigografie – rentgenové kontrastní vyšetření tlustého střeva.
CT vyšetření
Magnetická rezonance.