Chirurgie měkkých tkání zahrnuje různé typy operací, které jsou prováděny na měkkých tkáních těla, jako jsou orgány, cévy a kožní vrstva.
Hlavní aplikace měkotkáňové chirurgie zahrnují břišní chirurgii, hrudní chirurgii, chirurgii horních dýchacích cest a krku, kožní chirurgii a další specializované oblasti.
Břišní chirurgie: kastrace, profylaktická gastropexe, operace na játrech a slinivce břišní (cholecystektomie, stentování žlučovodů, odstranění tumorů, onkologická chirurgie), operace na zažívacím aparátu (cizí tělesa, nádory, torze žaludku, plastiky pyloru, enterotomie, enterektomie a enterostomie atd.).
Operace na močovém aparátu (odstranění močových kamenů, odstranění tumorů, prostatektomie, terapie prostatických abscesů, nefrotomie a nefrektomie, ureterotomie, transpozice močovodů atd.), splenektomie, adrenalektomie.
Hrudní chirurgie: operace na jícnu (cizí tělesa, nádory), operace na plíci (cizí tělesa, torze plicního laloku, nádory plic), operace na srdci a velkých cévách (patentní ductus arteriosus botalli, cévní prstencové anomálie, perikardektomie), tumory stěny hrudního koše.
Chirurgie horních dýchacích cest a krku: rhinoplastiky, rhinotomie (cizí tělesa, tumory..), staphylektomie a palatoplastiky, tonsilektomie, laryngoplastiky, lateralizace arytenoidních chrupavek, operace na průdušnici (řešení cervikálního kolabsu, tracheostomie, resekce tracheálních prstenců), zákroky na štítné žláze.
Kožní chirurgie: excize novotvarů včetně různých rekonstrukčních technik (advancement flapy, transpozice kožních laloků, aplikace kožních expanderů), transplantace kůže (mash stěpy, punch štěpy), plastiky očních víček, operace uší a zvukovodů (Zepp plastika, totální ablace zvukovodů, bulotomie).